微生物分子生态领域专家，美国微生物科学院院士，上海交通大学生命科学技术学院特聘教授，微生物分子生态学与生态基因组学实验室主任，上海系统生物医学研究中心营养系统生物学实验室主任。

赵立平的研究方向为：微生物分子生态学（微生物群落的结构解析新技术，微生物群落元基因组学）；人体系统生物学（肠道菌群结构和功能变化与代谢性疾病发生发展的关系）；多元统计与生物信息在微生物生态学领域的应用研究等。